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如何设计装修二代测序NGS实验室 医疗机构 CEIDI西递

文章出处:技术支持|阅读量:629|发表时间:2020-12-22

在医学界,血液肿瘤是一类具有高度异质性的疾病,其诊疗需要结合形态学、免疫学、遗传学和分子生物学进行综合分析。血液肿瘤中常见的分子生物学异常主要包括基因突变、融合基因及基因异常表达。目前NGS在基因突变的检测方面应用最为广泛和成熟,CEIDI西递在本文整理的内仅涉及基因突变的检测。

二代测序NGS实验室,是一种用于基因检测(高通量测序检测)的实验室,建设二代测序NGS实验室的重点,主要在设计布局分区、 结构材料、气压调节、消毒、照明、传递窗几个方面。

二代测序(NGS)实验室装修设计行业规范 CEIDI西递

二代测序(NGS)实验室装修设计行业规范 CEIDI西递

一、二代测序NGS实验室的设计布局分区

二代测序NGS实验室的设计分区,主要将实验室划分为4个区域,即:试剂准备区、标本与文库制备区、文库扩增与检测区、测序区。

1. 试剂准备区

NGS实验室试剂准备区的区域功能及仪器配备如下:

(1)区域功能:用于实验项目所需试剂的配制、分装和保存。

(2)仪器配备:必须配备加样器、冰箱、分析天平、微量台式离心机、涡旋振荡器、移液器、可移动紫外灯、超净工作台等仪器设备。

2. 标本与文库制备区 

NGS实验室标本与文库制备区的区域功能及仪器配备如下:

(1)区域功能:用于血液处理、血浆制备、DNA提取、DNA片段化、DNA样品的纯化、DNA浓度检测、末端修复、接头连接、构建样本的测序文库。

(2)仪器配备:必须配备冷冻离心机、微量台式离心机、掌上三管离心机、涡旋震荡器、垂直混合仪、移液器、可移动紫外灯、生物安全柜、冰箱、托盘天平、Qubit 2.0核酸定量仪、电脑(可连接互联网)、条形码打印机、普通打印机、扫描枪、磁力架等仪器设备。

3. 文库扩增与检测区 

NGS实验室文库扩增与检测区的区域功能及仪器配备如下:

(1)区域功能:用于文库构建后的PCR扩增与纯化、文库浓度检测、文库的混合及混合后的质检分析。

(2)仪器配备:必须配备PCR仪、QPCR仪、Qubit2.0核酸定量仪、可移动紫外灯、超净工作台、冰箱、微量台式离心机、涡旋振荡器、UPS、冰箱、移液器、磁力架等仪器设备。

4. 测序区 

NGS实验室测序区的区域功能及仪器配备如下:

(1)区域功能:用于测序模板制备,如乳液PCR与磁珠富集回收,以及上机测序、数据分析、报告审核及发放。

(2)仪器配备:必须配备高通量测序仪、PC电脑、打印机、UPS、恒温金属浴、纯水仪、冰箱、微量台式离心机、涡旋振荡器、移液器、超净工作台、可移动紫外灯、磁力架、PCR仪等仪器设备。

二、二代测序NGS实验室的主体结构材料

二代测序NGS实验室设计装修要以彩钢板与铝合金材料为主体建材,室内阴角与阳角采用铝合金50内圆角铝,这样做的好处是内部结构牢固、密封性好,且不易污染、积尘。

三、二代测序NGS实验室的气压调节

二代测序NGS实验室在气压调节上,要在实验区的外墙和各扇门上安装风量可调的回风口,空气通过回风口向室内换气。

四、二代测序NGS实验室的消毒与照明

在消毒上,二代测序NGS实验室的实验区、缓冲区顶部、传送窗内部要配备用于消毒的紫外灯。如果要对实验桌进行局部消毒,还要配备移动紫外线灯;在照明上,照明设备必须不积尘、易清洁才行,这里CEIDI西递建议配备净化灯具。

五、二代测序NGS实验室的传递窗

传递窗分为机械连锁型与电子连锁型,二代测序NGS实验室设计装修建议配备前者,以便确保样本与试剂在传递过程中不会受到污染。

综上,NGS检测实验室的总体设计与要求应参考《分子病理诊断实验室建设指南(试行)》、《医疗机构临床基因扩增检验实验室工作导则》等行业文献和要求。检测人员、生物信息分析人员、报告分析人员和提供咨询人员应具备相应专业背景且经过相应培训取得上岗资质。实验室区域设置和环境需要满足实验环节和仪器要求。NGS检测试剂及测序平台应首选CFDA认可的产品。涉及实验室自配试剂、探针等,应该有严格的试剂制备标准操作规程(SOP),并经过临床实验室自建项目(LDT)验证合格后方可使用。

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