文章出处:技术支持|阅读量:2007|发表时间:2021-11-05
高通量测序实验室又称NGS实验室,以高通量测序技术为主要检测手段,完成临床疾病筛查或辅助诊断等项目。对于NGS实验室的设计,要参考《分子病理诊断实验室建设指南(试行)》、《个体化医学检测质量保证指南》、《肿瘤个体化治疗检测技术指南》、《个体化医学检测实验室管理办法》、《测序技术的个体化医学检测应用技术指南(试行)》进行、《高通量测序技术临床规范化应用北京专家共识(肿瘤部分)》、《国家卫生计生委关于印发医学检验实验室基本标准和管理规范(试行)的通知》等相关规范。>>>商务洽谈,点此处,在线咨询
NGS实验室的区域设置原则上需要满足《医疗机构临床基因扩增检验实验室工作导则》的要求,在不影响检测质量的前提下,分区可依据实际情况适当合并。对洁净环境来说,因为NGS项目检测中肿瘤诊断与治疗的要求最为严格,所以NGS的实验室相对常规PCR实验室来说,要求更高。
一般我们根据常规NGS操作步骤,NGS实验室大致可分为以下区域:
(1)试剂储存和准备区;
(2)样本前处理区;
(3)样本制备区;
(4)文库制备区;
(5)杂交捕获区/多重PCR区域(第一扩增区):
(6)纯化一区;
(7)文库扩增区(第二扩增区);
(8)纯化二区;
(9)测序区;
(10)洁净走廊及污染走廊区域。
肿瘤NGS诊断实验室平台主要区域及流转示意图
NGS实验室分区的要求目前在业内存在一定争议,有专家认为分区设置必要性不大且浪费空间,考虑到目前不同层级实验室的管理能力差异较大,为方便实验室进行质量管理,确保检测质量,NGS实验室建议根据拟开展的检测项目数量、检测技术流程、测序平台和工作量大小来制定分区设计的方案。建议实验室至少设置五个功能区:试剂存储和准备区、标本与文库制备区、文库扩增与检测区、测序区、数据分析与存储区。各区域的功能和相关要求如下。用于测序数据的分析与存储。数据应进行安全备份,并与互联网物理隔离。规定原始序列核心数据的保存期限。详细说明并记录数据存储路径。应说明数据库是否为云端存储以及数据库更新的程序和管理要求。
相关阅读:
临床基因扩增实验室建设医院PCR实验室设计装修及配套系统建设要点CEIDI西递