欢迎访问西递实验室官网,实验室设计装修认准西递!

NGS实验室装修设计:高通量测序实验室设计原则与独立分区 CEIDI西递

文章出处:技术支持|阅读量:2007|发表时间:2021-11-05

高通量测序实验室又称NGS实验室,以高通量测序技术为主要检测手段,完成临床疾病筛查或辅助诊断等项目。对于NGS实验室的设计,要参考《分子病理诊断实验室建设指南(试行)》、《个体化医学检测质量保证指南》、《肿瘤个体化治疗检测技术指南》、《个体化医学检测实验室管理办法》、《测序技术的个体化医学检测应用技术指南(试行)》进行、《高通量测序技术临床规范化应用北京专家共识(肿瘤部分)》、《国家卫生计生委关于印发医学检验实验室基本标准和管理规范(试行)的通知》等相关规范。>>>商务洽谈,点此处,在线咨询
  NGS实验室的区域设置原则上需要满足《医疗机构临床基因扩增检验实验室工作导则》的要求,在不影响检测质量的前提下,分区可依据实际情况适当合并。对洁净环境来说,因为NGS项目检测中肿瘤诊断与治疗的要求最为严格,所以NGS的实验室相对常规PCR实验室来说,要求更高。
  一般我们根据常规NGS操作步骤,NGS实验室大致可分为以下区域
  (1)试剂储存和准备区;
  (2)样本前处理区;
  (3)样本制备区;
  (4)文库制备区;
  (5)杂交捕获区/多重PCR区域(第一扩增区):
  (6)纯化一区;
  (7)文库扩增区(第二扩增区);
  (8)纯化二区;
  (9)测序区;

(10)洁净走廊及污染走廊区域。 

肿瘤NGS诊断实验室平台主要区域及流转示意图

肿瘤NGS诊断实验室平台主要区域及流转示意图

  NGS实验室分区的要求目前在业内存在一定争议,有专家认为分区设置必要性不大且浪费空间,考虑到目前不同层级实验室的管理能力差异较大,为方便实验室进行质量管理,确保检测质量,NGS实验室建议根据拟开展的检测项目数量、检测技术流程、测序平台和工作量大小来制定分区设计的方案。建议实验室至少设置五个功能区:试剂存储和准备区、标本与文库制备区、文库扩增与检测区、测序区、数据分析与存储区。各区域的功能和相关要求如下。
  1.试剂存储和准备区
  用于消耗品和试剂的存储和准备。消耗品和试剂应直接运送至该区域,不能经过文库制备区,试剂盒中的阳性对照及质控品不能保存在该区,应存储于标本与文库制备区。
  2.标本与文库制备区
  用于核酸(RNA、DNA)提取与存储;文库制备和杂交捕获。应符合生物安全二级实验室防护设备、个人防护和操作规范的要求。本区域设置正压条件(通常维持5 Pa的正压),以避免从邻近区进入本区的气溶胶污染。对具有潜在传染危险性的材料,应在生物安全柜内开盖和处理,同时应有明确的标本处理和灭活程序。若开展RNA测序检测,应设置RNA样本提取和样本制备特定区域。
  3.文库扩增与检测区
  文库扩增、文库检测与质控。为避免气溶胶所致的污染,应尽量减少在本区内的走动。所有经过检测的反应管不得在此区域打开。
  4.测序区
  用于测序标本上机检测的区域。如Illumina测序平台的温度在22℃左右,且温度波动上下不超过3℃,湿度在30%~75%之间;Thermofisher测台的温度在20~25℃,运行温度不超过30℃,详细要求依照厂商说明书。
  5.数据分析与存储区

用于测序数据的分析与存储。数据应进行安全备份,并与互联网物理隔离。规定原始序列核心数据的保存期限。详细说明并记录数据存储路径。应说明数据库是否为云端存储以及数据库更新的程序和管理要求。

  NGS实验室依据《生物安全实验室建筑技术规范》二级生物安全实验室标准建设,在此基础上还需要参考《高通量测序技术》进一步对NGS实验室的各环境参数进行严格控制,部分要求达到三级生物安全实验室的技术规范。一个规范的NGS检测实验室是获得准确检测结果的重要保障,在实验室运行过程中要始终坚持“工作有序、互不干扰、防止污染、报告及时”的基本准则。CEIDI西递作为NGS实验室专业的建设单位要对实验环境的达成负责,尤其是技术指标的达成要严谨,充分顾及仪器设备的环境因素,例如:放置测序仪的房间温度应控制在19-25℃,2小时温度波动要精确控制小于2℃,湿度应控制在30%-70%之间。NGS技术作为强大的医学检测技术,未来的应用会更加广泛。CEIDI西递也会在不断地建设实践过程中总结经验,以便更好地助力医学研究实践的落地工作。

      相关阅读:

  临床基因扩增实验室建设医院PCR实验室设计装修及配套系统建设要点CEIDI西递
  二代测序NGS实验室装修设计:行业规范
  如何设计装修二代测序NGS实验室医疗机构CEIDI西递

客服

电话

西递服务热线

400-666-1693

西递服务热线

021-62250299

微信

扫码咨询

回顶